兖州人民医院建于1897年（清光绪二十三年），始称“安多医院”，是德国人在鲁西南设立的最早利用西医手段治疗疾病的天主教会医院，距今已有110多年的历史。1955年被政府接管，与当时的兖州县人民医院合并，并称为兖州县人民医院。1992年兖州撤县设市，医院也随之改为现今的兖州市人民医院。

近年来，医院紧抓机遇，深化制度改革，加快建设和发展，服务功能不断完善，服务能力逐步提高，院容院貌、环境设施、仪器设备、服务功能都有了很大改善。目前，已发展成为以急救、儿科、妇产科、神经内、心血管、呼吸、消化、糖尿病、肿瘤、神经外、骨外、胸外、泌尿外等医学为特色，集医疗、教学、科研、预防、保健功能于一体，兖州市最大的“二级”甲等综合性医院。

医院占地面积35412m2，建筑面积50000m2，设病床501张，有在职职工740余人，其中高级职称专业技术人员99人，中级233人，具有硕士学位的20人，本科学历的263人。医院拥有美国64排128层螺旋CT机、1.5T磁共振、数字直线加速器、数字血管摄影系统、全数字乳腺摄影系统、DR、CR、数字胃肠机、模拟定位机、尖端心脏/腹部彩色超声机、四维彩超、电子腹腔镜、电子胃镜、肠镜、膀胱镜、全自动生化分析仪、五分类血球计数仪、ICU中央心电监护系统、全自动麻醉机、呼吸机、全自动病理切片机、超声乳化仪、超声刀等100余台（件）大型医院仪器设备.临床实现了网络化管理，应用了中央空调、中心供氧和中央吸引等。目前医院固定资产达1.9亿元（人民币）。医院开设有神经内、心血管、呼吸、消化、肿瘤、儿科、中医、普外、骨伤、骨病、胸外、泌尿外、神经外、五官妇科、产科等临床学科17个，影像、放射、检验等医技科室9个。设有保健中心，并附设兖州市急救中心，是济宁医学院、万杰医学院等高等医学院校教学医院。医院在急救复合外伤救治、急性心肌梗死抢救、脑外伤抢救、溶栓疗法治疗早期脑血栓、放射性介入治疗、有机磷农药中毒救治等方面，处于全省同类医院先进水平。

医院致力于医疗质量建设，于2002年通过了ISO9001：2000质量标准认证，实现了医院管理与国际标准的接轨。2008年，医院与山东省立医院建立战略联盟协作关系，成为省立医院的基层重点扶持单位，并由省立医院定期派专家来医院坐诊，在学科建设上受到省立医院的大力支持。因医院管理表现突出，先后获得“爱婴医院”、全省医院管理先进单位、质量管理效益年先进单位、卫生经济管理先进单位和爱国卫生先进单位、“省级花园式”单位等称号。